目前針對不同的功能性實驗室，有著不一樣的實驗室規劃。就如本文要講到的微生物實驗室，其有別于其他實驗室，其主要構成是由主體實驗室和輔助功能實驗室組成，設計方案也和其他實驗室大不相同。

微生物實驗室功能分區是由準備室、洗滌室、滅菌室、無菌室、恒溫培養室和普通實驗室六個主要分區組成。這些分區房間的共同特點是地板和墻壁的質地光滑堅硬，儀器和設備的陳設簡潔，便于打掃衛生。

一、準備室

準備室用于配制培養基和樣品處理等。室內設有試劑柜、存放器具或材料的專柜、實驗臺、電爐、冰箱和上下水道、電源等。

二、洗滌室

洗滌室用于洗刷器皿等。由于使用過的器皿已被微生物污染，有時還會存在病原微生物。因此，在條件允許的情況下，最好設置洗滌室。室內應備有加熱器、蒸鍋，洗刷器皿用的盆、桶等，還應有各種瓶刷、去污粉、肥皂、洗衣粉等。

三、滅菌室

滅菌室主要用于培養基的滅菌和各種器具的滅菌，室內應備有高壓蒸汽滅菌器、烘箱等滅菌設備及設施。

四、無菌室

無菌室一般為4 - 5 平方米、高 2.5 米的獨立小房間(與外間隔離)，專辟于微生物實驗室內。

五、恒溫培養室

培養室應有內、外兩間，內室是培養室，外室是緩沖室。小規模的培養可不啟用恒溫培養室，而在恒溫培養箱中進行。

六、普通實驗室

進行微生物的觀察、計數和生理生化測定工作的場所。室內的陳設因工作側重點不同而有很大的差異。一般均配備實驗臺、顯微鏡、柜子及凳子。實驗臺要求平整、光滑，實驗柜要足以容納日常使用的用具及藥品等。

七、更衣室

是進入無菌室之前工作人員進行更衣、洗手的地方。室內設置無菌室及緩沖室的電源控制開關和放置無菌操作時穿的工作服、鞋、帽子、口罩等。

八、辦公室

登記待檢驗樣品，出檢測報告，處理有關文件資料，放松休息等。

對于建立微生物實驗室，功能分區只是實驗室建設前期規劃，想要系統的解決實驗室建設難題，還需要做整體的規劃設計。